CRC候选关键基因及潜在疗效中药生物信息学分析

摘要：

目的 生物信息学分析寻找大肠癌(CRC)生物标志及治疗CRC的潜在中药.方法 检索并分析GEO数据库CRC相关的3个基因芯片(GPL27956、GSE128435和GSE156355),对差异表达基因(DEG)行GO与KEGG通路富集分析,从DEG中筛选关键基因,根据受试者工作特征曲线(ROC)下面积(AUC)值评估关键基因的诊断效能,绘制生存曲线,通过Coremine Medical对关键基因进行中药预测.结果 共得到41个DEG,4个关键基因(CD27、NEIL1、NLRP3、PRKACB),其中CD27、PRKACB、NEIL1表达预测CRC组织类型的AUC分别为0.889、0.889和0.833,CD27表达水平与CRC患者总生存期呈正相关.筛选出虎掌南星、秦皮、人参花等可能为CRC治疗潜在的分子药物来源.结论 筛选出了CRC候选关键基因及其潜在疗效相关中药,为CRC临床治疗的新靶点及新药研发提供了方向.

关键词：大肠癌、生物信息学、中药、差异表达基因

所属期刊栏目：51

分类号：R735.34(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;天津市卫生健康委员会科技项目

在线出版日期：2023-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：19-23