基于二代测序用于瘦素缺陷T2DM ob/ob小鼠与C57BL/6小鼠的转录组差异分析

摘要：

目的 探讨瘦素缺陷T2DM ob/ob.小鼠与C57BL/6小鼠胰腺组织差异性基因及相关的生物学功能.方法 取8周雌雄性ob/ob小鼠和C57BL/6小鼠,饲养2周后取胰腺组织进行转录组测序.采用二代测序进行转录组测序.使用edgeR包分析两小鼠胰腺组织的差异基因,使用DAVID数据库进行差异基因生物学功能及信号通路分析;寻找hub基因,分析基因间相关性及两组表达量差异.结果 取瘦素缺陷T2DM ob/ob小鼠和C57BL/6J小鼠的胰腺组织进行病理切片HE染色,观察ob/ob小鼠较正常小鼠胰岛增生、肥大,岛内β细胞核增多、密集,胞质减少,排列紊乱;胰腺组织提取的RNA进行转录组测序,经过滤、质控、比对后,ob/ob较C57BL/6J小鼠上调基因88个,下调基因94个,共182个;差异基因生物学功能和信号通路主要涉及翻译、rRNA加工、核糖体、细胞内核糖核蛋白复合物、胞质小核糖体亚基、粘着斑、细胞外泌体、核糖体的结构成分、RNA结合、mRNA结合和核糖体信号通路等;寻找 hub 基因,RPS12-ps3、Rps4x、Gm7536、Rpl7、Rp138、Rps7、Rps15a、Rps3a1、Rp117和 Rps27a,除 Rp17与Rps27a呈负相关外,其余均成正相关,hub基因在ob/ob小鼠中均较C57BL/6J小鼠低表达,差异具有显著性(P＜0.05).结论 ob/ob小鼠和C57BL/6J小鼠差异基因主要是核糖体蛋白基因,核糖体蛋白基因水平的降低可能影响rRNA加工中的关键蛋白的功能,从而可能导致T2DM的发生.

关键词：二代测序;瘦素缺陷;2型糖尿病;C57BL;差异性基因

所属期刊栏目：49

分类号：R587(内分泌腺疾病及代谢病)

在线出版日期：2021-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：512-517