期刊专题

10.15972/j.cnki.43-1509/r.2021.03.012

基于生物信息学筛选甲状腺癌关键基因和通路

引用
目的 探讨甲状腺癌(TC)发生发展的潜在生物学功能,筛选TC的关键基因和通路.方法 从GEO数据库中下载3组基因芯片数据集,分析TC组织与正常组织差异表达基因(DEGs),利用多种在线分析软件对DEGs进行功能富集、通路分析、构建蛋白质互作网络、筛选关键基因,然后采用TCGA数据库对关键基因进行验证及生存分析.结果 3组数据集分析得出410个共同DEGs,其中159个基因上调,251个基因下调.DEGs与癌症中的蛋白聚糖、P53信号通路、ECM-受体相互作用、细胞周期等信号通路有密切关系.筛选出14个关键基因,分别是CCNB2、FN1、MMP9、TIMP1、CXCL8、VCAN、EVA1A、LGALS1、KIF15、KIF20A、KIF4A、TOP2A、JUN和SDC2,其中MMP9、SDC2、KIF15和VCAN影响患者生存率,提示可以作为TC的潜在预后标志物.结论 利用生物信息学方法筛选出14个关键基因和通路,可能有助于甲状腺癌的早期分子诊断与基因靶向治疗.

甲状腺癌、生物信息学分析、关键基因、基因芯片

49

R736.1(肿瘤学)

上海市闵行区医学特色专科项目2020MWFC03

2021-06-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共5页

305-309

暂无封面信息
查看本期封面目录

中南医学科学杂志

2095-1116

43-1509/R

49

2021,49(3)

专业内容知识聚合服务平台

国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

©天津万方数据有限公司 津ICP备20003920号-1

信息网络传播视听节目许可证 许可证号:0108284

网络出版服务许可证:(总)网出证(京)字096号

违法和不良信息举报电话:4000115888    举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn

举报专区:https://www.12377.cn/

客服邮箱:op@wanfangdata.com.cn