基于改进RankComp的个体化差异表达基因识别算法

摘要：

针对RankComp算法存在统计效能低的问题,为提升统计效能,提出RankComp+算法.RankComp+算法通过调整RankComp算法筛选稳定基因对的策略,并添加差异表达基因迭代筛选过程对RankComp算法进行改进.在仿真数据实验和肺癌配对样本数据实验中,RankComp+算法均表现稳定且优于其他算法.在缺血性心肌病数据中,RankComp+算法找出的差异表达基因显著富集到新的生物学通路,证明了RankComp+算法得出的结果具有生物学意义.综上,RankComp+算法能够稳定用于个体化差异表达基因识别并为疾病机理研究提供新的信息.

关键词：个体化;差异表达;基因表达丰度排秩;稳定基因对;逆转基因对

所属期刊栏目：42

分类号：TP393(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目61662028

在线出版日期：2021-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：89-96