滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析

摘要：

采用PCR产物直接测序法测定了14尾滁州鲫（ Carassius auratus gibelio in Chuzhou）的线粒体细胞色素b（ Cy-tochrome b，Cyt b）基因和控制区（ D-loop）全序列，长度分别为1141 bp和924 bp，且均无核苷酸变异位点。Cyt b基因的T、C、A 和 G 含量分别为29.2％、27.8％、28.5％和14.5％；D-loop 的 T、C、A 和 G 含量分别为33.2％、20.1％、32.6％和14.1％。2种序列中 A＋T含量（57.7％，65.8％）均明显大于 G＋C含量（42.3％，34.2％），且G含量偏低，显示了与其他水生动物线粒体核苷酸碱基含量相似的特征。通过对滁州鲫的控制区结构进行分析，识别了其终止序列区（ ETAS）、中央保守区（ CD）和保守序列区（ CSB）的关键序列。滁州鲫与其他鲫属鱼类的Cyt b和D-loop序列均具有高度的相似性，分别为93％~100％和94％~99％。基于2种序列的分子系统进化树分析均表明，滁州鲫与方正鲫（ C. auratus gibelio in Fangzheng）亲缘关系最近，而与来自日本的鲫类群亲缘关系最远。

关键词：滁州鲫、细胞色素b、控制区、系统进化分析

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：国家星火计划项目2013GA710001；安徽省农业科学院成果推广项目12E0505，13E0504；安徽省“115”产业创新团队皖人才办[2009]2号

在线出版日期：2015-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：101-108