RGS2在泛癌中诊断、预后和免疫浸润的分析

摘要：

为探究G蛋白信号调节蛋白 2(Regulator of G Protein Signaling 2,RGS2)在泛癌中的表达与预后和免疫浸润的关系,利用生物信息学方法、结合R语言与多个数据库进行了深入分析.首先,通过TCGA数据库分析RGS2在 33种癌症肿瘤组织与正常组织中的差异表达,并通过GEO数据库对部分结果进行验证;再通过Cox回归分析与log-rank检验进行预后分析.接着进行免疫浸润分析,并通过ssGSEA分析RGS2对免疫微环境的影响;根据RGS2表达的高低分组获取差异基因,并通过Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析找到与RGS2相关的分子通路.最后,通过 STRING数据库、GENEMANIA数据库获取 RGS2的相关基因,搭建蛋白互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI).结果表明,RGS2表达量在 24种癌症肿瘤组织显著下调,在 4种癌症中显著上调.RGS2在膀胱尿路上皮癌、肾透明细胞癌、肝细胞肝癌、胃腺癌中为危险因素,但在皮肤黑色素瘤、子宫癌肉瘤为保护因素.免疫浸润分析结果表明,RGS2表达与多数免疫细胞表达量显著正相关,但与Th17细胞表达量显著负相关.富集分析表明,RGS2与补体活化、免疫球蛋白受体结合等功能和通路密切相关.PPI蛋白互作网络显示RGS2与RGS4、GNA11、GNA14等基因具有显著相关性.综上所述,RGS2在 28种癌症中显著差异表达,可作 6种癌症的独立预后因子,与多种癌症的免疫浸润水平显著相关.因此,RGS2有望成为多种癌症的诊断、预后、免疫浸润的新型生物标志物,有望成为一种新的治疗靶点.

关键词：泛癌、RGS2、诊断、预后、免疫浸润

所属期刊栏目：37

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金62261039

在线出版日期：2023-08-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：78-88