青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析

摘要：

为研究青海省小麦品种之间的遗传关系和遗传多样性,选取93个青海小麦品种,基于55KSNP芯片对其进行全基因组扫描,并进行遗传多样性分析.结果共扫描到53 063个SNP位点,选择分型成功率(call rate,CR)≥0.90、缺失率＜10％、MAF＞0.05的SNP位点,获得多态性SNP位点50 243个,多态性比率为94.68％.其中多态性位点在第2同源群中分布最多,在第4同源群中分布最少,在基因组中分布呈现B＞A＞D,特别是4D染色体上的多态性SNP分布最少.93个小麦品种的多态性信息含量(PIC)为0.00～0.59,平均值为0.33,为中度多态性位点;两两品种间的遗传距离为0.00～0.67,平均值为0.41.通过聚类分析表明,根据遗传距离可将93个小麦品种划分为8个类群.综上,青海省现有小麦品种的遗传关系较近,需要引进外来品种来丰富青海省小麦品种的遗传多样性,推动小麦品种的选育及研究工作.

关键词：青海省、小麦、55K SNP、遗传多样性

所属期刊栏目：42

分类号：S512.1;S330(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金32060612

在线出版日期：2023-02-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1343-1350