小麦TCP基因家族的全基因组鉴定和对热胁迫的响应

摘要：

TCP是植物发育调控的重要转录因子.为了挖掘小麦TCP基因的功能,本研究利用生物信息学方法和qRT-PCR技术,对小麦TCP基因家族进行全基因组鉴定和在热胁迫下的表达分析.全基因组鉴定结果表明,普通小麦品种中国春中存在58个非冗余的TaTCP基因.根据与AtTCPs和OsTCPs的系统发育分析,在小麦中分别有26个PCF、20个CIN和12个CYC/TB1聚类.进一步预测TaTCP基因在达尔文进化下的压力选择,发现除了TaTCP16-A相对于乌拉尔图小麦中直系同源基因是正向选择,其他基因都是纯化选择的过程.利用在线RNA-seq数据分析TaTCPs基因在5种组织器官中与冷、热和干旱胁迫下的表达图谱,结果显示,小麦TCP基因在不同的组织和胁迫中存在差异表达.最后,通过qRT-PCR技术检测12个不同发育阶段的小麦叶片在短期热胁迫下TaTCP5部分同源基因的表达水平,结果表明,在35℃下处理1h,TaTCPS-D的相对表达量在拔节期、拔节后期、孕穗前期和抽穗期都有明显的上调,这些结果为进一步研究TaTCP基因的功能奠定了良好的基础.

关键词：小麦、TCP、基因家族、全基因组鉴定、热胁迫

所属期刊栏目：38

分类号：S512.1;S330(禾谷类作物)

资助基金：西北农林科技大学作物转基因平台建设项目Z101021602

在线出版日期：2019-01-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1157-1165