滨麦叶片转录组分析

摘要：

滨麦(Leymus mollis)是小麦的野生近缘种,具有良好的耐盐抗旱和抗病虫害的能力,是小麦遗传育种的良好资源.为了深入了解和挖掘滨麦的基因信息和优异资源,本研究利用高通量测序技术对生长于滨海沙地的野生滨麦的叶片转录组进行了深度测序并组装,对得到的所有Unigene进行COG、GO和KEGG分类和功能注释,对Na+转运相关蛋白基因和氧化胁迫响应基因进行了挖掘,并通过实时荧光定量反转录PCR(qRT-PCR)对随机选取的12个基因的表达模式进行了验证.结果显示,转录组测序共获得112 846条Unigene,其中的59 380条得到功能注释,占总数的52.62％.COG分类结果表明,15 786条Unigene归属于25个类别.GO分类结果表明,20 350条Unigene被注释到三个大类中,其中,属于“生物学过程”的Unigene数量最多,占总数的43.56％.KEGG分析结果表明,18 550条Unigene得到注释,共涉及到128条代谢途径.其中,含Unigene数量最多的类别是“代谢通路”,涉及到的Unigene占总数的27.86％.“植物病原互作”和“植物激素信号转导途径”涉及的Unigene数量也较多,分别为1 367条和861条.对Na+转运相关蛋白基因和氧化胁迫响应基因进行挖掘,发现了15条注释为Na+/H+反向转运蛋白的Unigene和175条响应氧化胁迫的Unigene.随机选取的12个基因的qRT-PCR结果与转录组测序结果基本一致.

关键词：滨麦、叶片、转录组分析、Na+转运蛋白基因、氧化胁迫响应基因

所属期刊栏目：38

分类号：S512.9;S330(禾谷类作物)

资助基金：山东省自然科学基金项目ZR2012CL13;国家自然科学基金项目31400226;山东省高等学校科技计划项目J14LE07;鲁东大学学生创新课题

在线出版日期：2018-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1084-1093