滨麦蔗糖:果聚糖6-果糖基转移酶(6-SFT)基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

摘要：

为了挖掘和利用滨麦(Leymus mollis,2n=4x=28,JJNN)的优良基因,以拓宽小麦非生物胁迫抗性基因资源,以滨麦为材料,利用RT-PCR结合RACE技术从滨麦叶片中克隆到6-SFT基因cDNA的全长序列,并对其进行生物信息学分析.结果表明,其cDNA全长为2 086 bp,开放阅读框为1 866 bp(命名为Lm-6-SFT),编码621个氨基酸;其推导的蛋白分子量为69.1 kDa,理论等电点(pI)为5.18,属于酸性蛋白.保守结构域分析表明,该基因推导的氨基酸序列含有SDPDG、RDP和EC结构域.多序列比对及进化树分析表明,滨麦6-SFT与冰草6-SFT在氨基酸水平具有高度的序列相似性.

关键词：滨麦、6-SFT基因、克隆、序列分析

所属期刊栏目：36

分类号：S512.1;S330(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31571650;西北农林科技大学唐仲英育种基金

在线出版日期：2016-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：549-555