小麦PM H~+-ATPase基因克隆及其推定的蛋白结构分析

摘要：

为了解小麦PM H~+-ATPase的基因全序列及其相关生物信息学特征,以豫麦18的基因组DNA为材料,用Full-Tail-PCR方法首次克隆到了小麦PM H~+-ATPase基因的启动子,并用分段克隆方法克隆了其全长序列(登录号:AY829002).DNA序列分析结果表明,该基因全长5 770 bp,含有15个外显子和14个内含子,其中第一个内含子片段较大,长达1 432 bp.碱基组分分析结果表明,该基因的启动子及5′UTR全长分别为161和201 bp,G+C含量分别高达72.1%和72.6%.对其生物信息学特征分析结果表明,该蛋白由951个氨基酸组成,分子量为104.6 kD,有44个功能位点,10个跨膜区,1个Cation-ATPase结构域,1个E1-E2-ATPase结构域和1个水解酶结构域.与其他植物序列比对分析结果表明,不同植物来源PM H~+-ATPase具有较高的保守性.该基因结构及其推定产物结构的复杂性说明该基因在生命活动调节中的精确性.

关键词：小麦、PM H~+-ATPase、基因克隆、蛋白结构

所属期刊栏目：29

分类号：S512.1;S330(禾谷类作物)

资助基金：国家转基因植物研究与产业化专项基金项目JY03-B-19-2;河南省杰出人才创新基金项目022100090

在线出版日期：2010-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：947-953