小麦EST数据批量分析平台的构建与应用

摘要：

为进行EST数据批量分析,构建了EST/cDNA序列数据高通量、自动化分析平台.该平台基于Linux操作系统,主要由一些免费软件和perl程序构成,具有自动组装EST序列、查找同源基因、注释基因功能,同时具有进行基因分类等功能.利用该平台对小麦水分胁迫诱导表达的5个cDNA文库的6 733条EST序列进行全面分析,初步建立了小麦水分胁迫诱导的基因表达谱.检测结果表明,小麦EST数据批量分析平台为批量EST序列的生物信息学分析提供了实用、便捷工具.

关键词：小麦、EST数据、批量分析、生物信息学、水分胁迫、cDNA

所属期刊栏目：26

分类号：S512.1;S325(禾谷类作物)

资助基金：国家转基因研究与产业化专项JY03-A-14

在线出版日期：2015-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：146-151