棉花HDAC基因家族鉴定及其在黄萎病菌侵染下的表达分析

摘要：

[目的]组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDAC)在植物发育及抗病应答中发挥重要作用,本研究旨在鉴定棉花HDAC基因家族成员并对其在黄萎病抗性中的作用进行分析.[方法]利用生物信息学方法对棉花基因组中HDAC基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、系统发育关系、基因结构进行系统分析.利用实时荧光定量聚合酶链式反应分析了黄萎病菌诱导下瑟伯氏棉HADC基因的表达模式.[结果]陆地棉、亚洲棉和瑟伯氏棉基因组中分别包括30、15和13个HDAC基因.棉花HDAC分为RPD3/HDA1、HD2和SIR2三个亚族,同一亚族成员间具有相似的基因结构和保守基序.棉花HDACs基因启动子中含有大量的激素应答、胁迫响应以及植物生长发育相关的顺式作用元件.瑟伯氏棉GthHDAC基因响应乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导;在黄萎病菌胁迫下,多数GthHDAC基因上调表达,表明该基因家族可能通过乙烯/茉莉酸和水杨酸等信号通路调控棉花黄萎病抗性.[结论]本研究从全基因组水平上鉴定了亚洲棉、陆地棉和瑟伯氏棉中58个HDAC家族基因,并明确了瑟伯氏棉HDAC家族成员在黄萎病菌胁迫下的表达模式.黄萎病菌处理后,大部分GthHDAC基因在叶片中上调表达,并且受到乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导.

关键词：棉花、HDAC、抗黄萎病、全基因组家族鉴定、基因表达

所属期刊栏目：33

分类号：S436.611.1;Q786;S562

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;湖南省自然科学基金

在线出版日期：2022-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：469-481