高通量测序技术研究棉蚜携带病毒种类

摘要：

棉蚜是传播寄主植物病毒的主要昆虫媒介,但对棉蚜携带的病毒种类及病毒基因组序列信息了解较少.本文利用高通量测序技术,对棉蚜田间自然种群所携带的病毒基因序列进行发掘、鉴定和分类.通过对田间苗蚜和伏蚜转录组数据进行分析,获得18种病毒基因组序列,其中17种病毒为未报道过基因组信息的种类.在18种病毒中,有13种为正链RNA病毒.苗蚜携带病毒的种类和数量都远远高于伏蚜,苗蚜携带全部的18种病毒;伏蚜仅携带8种,而且携带病毒的FPKM(Fragments per kb per million fragments)值较低.本研究丰富了棉蚜所携带的病毒基因组信息,为棉蚜传毒机制研究打下基础.

关键词：棉蚜、病毒、高通量测序、基因组、转录组

所属期刊栏目：26

分类号：S435.622(病虫害及其防治)

资助基金：转基因生物新品种培育重大专项2014ZX08012-004

在线出版日期：2015-02-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：539-545