基于蚁群算法的分子对接搜索方法研究

摘要：

分子对接方法研究生物大分子的相互作用与识别机制,对了解生命现象及其本质规律具有重要的理论和应用价值.本文采用蚁群算法对分子对接程序Autodock 3.0的能量寻优过程进行了改进.测试了22个蛋白质-小分子体系,与原程序相比较,蚁群算法能够有效地改善程序的搜索结果.同时,比较了采用局部搜索和未采用局部搜索的算法,蚁群算法也比原程序有更好的表现.蚁群算法对分子对接的搜索方法进行了新的尝试,将对分子对接软件的改进提供一些启示.

关键词：分子对接、蚁群算法、遗传算法、能量优化

所属期刊栏目：25

分类号：Q615;O246(理论生物物理学)

资助基金：广东省科技计划资助项目2007B020706006,2007B020715001

在线出版日期：2010-07-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：45-47,76