'红阳'猕猴桃软腐病病原菌细极链格孢菌的基因组组装与功能分析

摘要：

以'红阳'猕猴桃软腐病病原菌细极链格孢菌为材料,利用三代结合二代测序技术对其进行基因组测序.结果表明,组装的细极链格孢菌基因组大小为33.87 Mb,N50长度为6.8 Mb,GC含量为50.87%.基因组的组装共产生10条scaffolds,其中5条scaffolds两端包含端粒重复序列(TTAGGG),而另外5条仅一端有端粒重复序列.预测的11 726个基因包括34个ncRNAs、118个tRNAs、25个rRNAs和11 549个编码基因.对编码基因进行COG、GO和KEGG功能注释,表明碳水化合物的转运和代谢相关基因发挥重要功能.此外,发现有569个碳水化合物活性酶(CAZymes)基因.这些结果可为解析细极链格孢菌的致病机制提供基础数据.

关键词：’红阳’猕猴桃、软腐病、细极链格孢菌、基因组、碳水化合物活性酶

所属期刊栏目：36

分类号：S435.6(病虫害及其防治)

资助基金：六盘水市科技发展项目;六盘水师范学院大学生创新训练项目;猕猴桃软腐病菌拟茎点霉菌的致病代谢物鉴定

在线出版日期：2024-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：92-100