基于生物信息学分析乌司奴单抗治疗寻常型银屑病不应答的关键基因和信号通路

摘要：

目的 应用生物信息学技术寻找乌司奴单抗治疗寻常型银屑病无应答患者中的差异表达基因,分析信号通路,探讨不应答机制.方法 在 Gene Expression Omnibus(GEO)下载 GSE117239 数据库.以 P<0.05 及|logFC|≥1.5 为标准筛选表达差异基因.通过 String 数据库进行蛋白互作网络(PPI)分析,使用 Cyto-scape的cytohubba插件提取关键目标和子网络.使用Funrich对表达差异基因进行GO分析,最后使用Consen-susPathDB数据库进行KEGG pathway分析.结果 发现 76 个差异基因,其中上调基因 48 个,下调基因 28 个.GO分析显示上调基因主要富集的生物过程为细胞定位、免疫效应过程、细胞组分生物合成、细胞活化、细胞死亡.下调基因主要富集的生物过程为调节血液循环、血管生成、血管发育以及组织迁移等.KEGG分析显示差异基因主要富集的信号通路为:核糖体、凋亡、多糖降解、溶酶体等信号通路.PPI网络分析出的 10 个枢纽基因为:CCL20、CXCL9、S100A9、S100A12、ARG1、OAS1、OASL、IL36G、SERPINB4、KRT16.结论 CCL20、CXCL9、S100A9等基因可能在乌司奴单抗治疗寻常型银屑病不应答中发挥关键作用.

关键词：寻常型银屑病、乌司奴单抗、生物信息学、差异基因、富集分析

所属期刊栏目：26

分类号：S828;Q78;R735.2

资助基金：河南省医学科技攻关计划联合共建项目LHGJ20200950

在线出版日期：2023-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：494-499