探究染色质调节因子在胃癌进展中的作用及潜在治疗靶点

摘要：

目的 探讨染色质调节因子(Chromatin regulators,CRs)在胃癌(Gastric cancer,GC)患者中的功能、预后价值及潜在治疗靶点.方法 采用 GEO 数据库中的 GEO2 R 在线分析工具对微阵列数据研究集GSE26942 和GSE79973 进行差异基因分析,与染色质调节因子基因集取交集基因获得差异基因,对差异基因进行差异基因本体分析(Gene ontology,GO)与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析.通过String(蛋白相互作用分析数据库)构建差异基因的蛋白相互作用网络,使用Cytoscape软件中的 cytoHubba插件获得hub基因(中枢节点基因),构建hub基因胃癌预测模型,绘制列线图、校准曲线(Calibration curve)及受试者工作特征曲线(ROC,Receiver operating characteristic curve)曲线,并预测潜在治疗药物.结果 生物信息学分析显示,GSE26942 和GSE79973 中染色质调节因子有137 个差异基因,其中上调基因93 个,下调基因44 个.采用cytoHubba插件获得hub基因为 BRCA2、BARD1、RAD51、NBN、PCNA、TP53BP1、E2F6、RUVBL1、RUVBL2、WDR5,在胃癌的预测模型中,RUVBL1 基因的预测性最佳.并根据 hub 预测相关潜在治疗药物有氟达拉滨、硝酸钾等.结论 染色质调节因子在胃癌发生发展中起重要作用,并找到胃癌的预测基因及潜在治疗药物.

关键词：胃癌、差异表达基因、生物信息学、核心基因

所属期刊栏目：26

分类号：O186;R-058;R735.7

资助基金：青海省自然科学基金项目;青海省昆仑英才;高端创新创业人才领军人才项目

在线出版日期：2023-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：488-493