基于生物信息学分析VAMP8在乳腺癌中的表达情况及调控机制

摘要：

目的 基于生物信息学分析囊泡相关膜蛋白8(VAMP8)在乳腺癌中的表达情况及调控机制,并分析VAMP8高表达与患者预后的关系.方法 用Oncomine数据库获取VAMP8在癌症组织及正常组织中的差异表达,用HPA数据库分析乳腺癌中VAMP8的阳性表达情况.用cBioP ortal数据库获取VAMP8的共表达基因,随后用String数据库构建VAMP8共表达基因的蛋白质互作网络,最后用David数据库分析其GO生物学功能及KEGG信号通路富集.结果 Oncomine数据库显示,VAMP8在癌症组织及正常组织中有317个数据集,在癌症组织中有36个高表达数据集、23个低表达数据集,其中乳腺癌组织中有12个高表达数据集,中位等级为191.5,P=4.89e-38.HPA数据库显示,VAMP8在乳腺癌组织中呈中、高度阳性表达,阳性蛋白主要集中在细胞质或细胞膜内.String数据库显示,有47种蛋白质与VAMP8有着直接或间接的联系.David数据库显示了VAMP8共表达基因在乳腺癌中的具体调控机制.乳腺癌患者的无病生存期(DFS)缩短与VAMP8的高表达有关(P=0.0183).结论 VAMP8在乳腺癌组织中呈中、高度阳性表达,其可作为评估患者预后的分子标志物及基因治疗靶点.

关键词：乳腺癌、囊泡相关膜蛋白8、生物学功能、信号通路

所属期刊栏目：6

分类号：R737.9(肿瘤学)

在线出版日期：2021-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：32-36