转录组测序筛选肝癌细胞中CUG2的作用靶点

摘要：

目的 通过转录组测序以及生物信息学分析对CUG2的下游差异性表达基因进行功能分析,探讨CUG2在肝癌发生、发展过程中的分子机制及作用.方法 将CUG2 siRNA转染入肝癌细胞HepG2与Huh7,采用RNA-Seq技术筛选CUG2的下游差异表达基因;利用DAVID和STRING数据库分析差异性表达基因功能、信号通路和蛋白相互作用,确定CUG2下游靶基因.采用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析靶点蛋白在生存预后分析中的价值.结果 HepG2细胞敲降CUG2后有420个基因上调,367个基因下调;Huh7细胞敲降CUG2后有2376个基因上调,1799个基因下调.FGB、GC、CENPF、CENPP、TOP2A、PGK1、EPO、CXCL1、CXCL8和KLF2均为CUG2的下游靶基因,生物信息学分析发现这些靶点蛋白与肝癌患者生存预后相关.结论 肝癌发生、发展过程涉及多个与癌症相关的生物学过程和信号通路的改变,CUG2的下游作用靶点与肝癌患者的生存预后相关.

关键词：肝细胞癌、CUG2、转录组测序

所属期刊栏目：6

分类号：R735(肿瘤学)

资助基金：深圳市重点学科建设经费资助No.HKUSZH201901002

在线出版日期：2021-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：6-11