增龄相关慢性萎缩性胃炎的生物信息学分析

摘要：

目的 应用生物信息学方法,探究增龄相关慢性萎缩性胃炎的潜在基因及生物调控途径.方法 运用4大基因信息数据库,筛选调控增龄、萎缩和胃炎的基因,使用DAVID在线工具,进行基因功能注释及通路分析,利用STRING数据库,构建蛋白质相互作用网络(PPI),寻找核心基因及调控模块,并预测相关的miRNAs.结果 共筛选出860个共同靶点基因,分子功能集中在信号受体激活,细胞组分定位主要在细胞膜外侧,miRNA信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、动脉粥样硬化等有较多的靶点基因富集.PPI分析显示,白细胞介素(IL)-6、IL-10和白血病抑制因子(LIF)是核心基因.miRNAs预测显示:miR-223-3p、miR-106a-5p及miR-98-5p可能参与增龄相关慢性萎缩性胃炎的发生、发展.结论 IL-6、IL-10和LIF基因及miR-223-3p信号通路可能是治疗增龄相关慢性萎缩性胃炎的靶点.

关键词：增龄相关慢性萎缩性胃炎、生物信息学、潜在基因、调控途径

所属期刊栏目：23

分类号：S852.65;Q78;R318

资助基金：国家自然科学基金81902472

在线出版日期：2024-09-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1345-1349