原发性干燥综合征差异基因及潜在治疗药物的生物信息分析

摘要：

目的 利用基因表达谱筛选与原发性干燥综合征(pSS)相关基因和潜在小分子治疗药物.方法 在GEO数据库获取并分析3个pSS相关基因表达谱,获得差异表达基因,并对差异基因进行GO与KEGG富集分析,通过蛋白互作网络(PPI)筛选pSS的hub基因并验证.最后,利用Cmap数据库预测pSS的潜在治疗药物,并结合药物靶点和药物途径探讨潜在药物在pSS治疗中的作用.结果 共鉴定出90个pSS相关差异基因,其中79个上调基因,11个下调基因,它们主要参与NOD样受体信号通路、甲型流感和细胞因子-细胞因子受体相互作用通路.此外,通过筛选、验证,鉴定出19个hub基因(STAT1、MX1、ISG15、IFIH1、GBP1、IFIT1、XAF1、RSAD2、IFIT2、SAMD9L、TRIM22、IFIT3、IFI44L、HERC5、IFIT5、IFI44、IFI6、RTP4和ISG20),多个是干扰素诱导基因.干扰素可能在pSS发病中起重要作用.最后,通过CMAP数据库筛选出氟替卡松、氯唑西林等15种候选药物,并对其作用通路与靶点分析.结论 本研究通过对pSS hub基因和候选药物的筛选,可以进一步了解pSS的发病机制,为pSS的进一步研究提供线索.

关键词：干燥综合征、生物信息、差异基因

所属期刊栏目：35

分类号：R593.22(全身性疾病)

在线出版日期：2020-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：533-540