基于数据挖掘分析ERO1 L在肺腺癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 探索内质网氧化还原1样蛋白(endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like protein,ERO1L)在肺腺癌中的表达及意义.方法 利用cBioPortal在线分析癌症基因图谱(The Cancer Genome At-las,TCGA)数据库中586例肺腺癌样本中的RNA-Seq数据,并结合患者的完整生存时间信息,采用Kaplan-Meier法分析ERO1L变异与肺腺癌患者生存之间的关系.通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profi-ling Interactive Analysis,GEPIA)数据库搜索ERO1L mRNA在正常肺组织与肺腺癌组织表达的情况,分析其在不同TNM分期中的表达情况.用MethHC数据库分析ERO1L基因在肺腺癌中的甲基化水平.String-DB数据库分析与ERO1L相互作用的蛋白.结果 在230例肺腺癌样本中有18例发生ERO1L基因变异,变异率为8％.Kaplan-Meier生存曲线分析显示ERO1L变异组总体生存期(overall survival,OS)短于无变异组(P=0.0268).肺腺癌组织中ERO1L mRNA表达明显高于正常肺组织(P<0.05),且其启动子甲基化水平显著减低(P<0.005).ERO1LB、ERP29、ERP44、GPX7、GPX8、INS、P4HB、PDIA4、PDIA6、TXNDC5等基因与ERO1L有明显的相互作用.结论 通过肿瘤基因数据库信息挖掘表明,ERO1L在肺腺癌组织中呈高表达,且与患者预后不良相关,为深入研究ERO1L在肺腺癌发生发展中的作用提供重要理论依据.

关键词：ERO1L、肺腺癌、TCGA、cBioPortal、GEPIA、数据分析、预后

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资助基金：国家临床重点专科建设项目,江苏省青年卫生人才项目QNRC2016745;江苏省"科教强卫工程"青年医学人才QNRC2016747;姑苏卫生青年拔尖人才

在线出版日期：2018-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2229-2233