人类基因组CpG岛甲基化概况的预测

摘要：

CpG岛甲基化在细胞的各种生物过程中扮演着重要角色.开发了预测人类基因组CpG岛甲基化状态的计算模型,获得了目前最好的预测性能,并用此模型对人类全基因组的CpG岛甲基化状况进行了预测.根据预测结果,约31%的CpG岛处于甲基化状态,而位于启动子区的CpG岛则倾向于不被甲基化.染色体R带和G带中CpG岛的甲基化水平没有显著差异.基因启动子区内,不易被甲基化的CpG岛中RNA聚合酶的结合强度显著高于易被甲基化的CpG岛,表明包含不易被甲基化的CpG岛的启动子对应的基因具有更高的表达活性.

关键词：DNA甲基化、CpG岛、预测模型、特征选择

所属期刊栏目：55

分类号：Q2(细胞生物学)

资助基金：国家自然科学基金30625012;60721003;国家重点基础研究发展计划2004CB518605

在线出版日期：2011-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1329-1334