应用比较基因组分析检测乙型肝炎病毒中可能的重组事件

摘要：

应用生物信息学软件RDP3和Simplot及5种重组检测算法(RDP,GENECONV,MaxChi,Chimaera和SiScan),对791个人类乙型肝炎病毒(HBV)全基因组和38个非人灵长类乙型肝炎病毒全基因组序列进行了比较分析,以检测可能的重组事件及重组子.用RDP3检测出9个重组事件及61个重组子,并用Simplot分析确定了具有两条亲代序列的6个事件中重组发生的位置.61个重组子中53个为首次发现.研究还表明PreC/C基因区域和基因边缘附近发生重组频率较高.

关键词：乙型肝炎病毒、重组、RDP3、Simplot

所属期刊栏目：55

分类号：R5(内科学)

资助基金：上海市重点学科项目B111;上海市科委项目07XD14025

在线出版日期：2011-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1322-1328