氨基酸广义疏水标度(GH-scale)用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量预测

摘要：

将天然氨基酸149个疏水性质经主成分分析得到了一种新氨基酸描述子--氨基酸广义疏水标度(GH-scale).用GH-scale结合遗传偏最小二乘(GPLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行定量构效关系(QSAR)研究.所建模型拟合及交叉检验复相关系数分别为R2cum=0.813和Q2=0.725.研究表明,疏水作用在CTL表位与HLA-A*0201结合过程中扮演极其重要角色,而锚定残基是该类作用发生最显著的部位.

关键词：广义疏水标度、HLA-A*0201、CTL表位、定量构效关系、遗传偏最小二乘

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分类号：Q5(生物化学)

资助基金：国家重点实验室基金2005012;教育部霍英东教育基金98-8-7;重庆市应用基础研究基金01-3-6;教育部春晖计划项目99-4-4+37;教育部重大项目03-0506+04-0909;第三军医大学校科研和教改项目05-5-28

在线出版日期：2006-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1259-1263