志贺氏菌属各亚群菌株基因组"共有骨架"组成的分析

摘要：

不同原核生物在基因组组成上的差异是其生物学性状差异的基础. 然而,进化中亲缘关系较近的菌群, 其基因组除了含有群或株特异的基因外, 还含有反映它们起源和进化痕迹的"共有骨架"结构, 而这些"共有骨架"恰恰是它们基本生存能力和共有生物学性状的基础. 志贺氏菌在起源和进化上与大肠杆菌极为密切, 目前倾向于将二者划为同一个种. 利用大肠杆菌K-12全基因组及Sf301特异性ORFs的芯片研究了志贺氏菌4个群间的基因组组成. 结果显示, 分别有16% ～ 22% K-12的ORFs序列没有在志贺氏菌的基因组中被检测出, 而志贺氏菌的基因组中包含至少2800个保守的ORFs, 组成了其共有的"共有骨架". 进一步分析提示, 这些"共有骨架"是维持肠道细菌正常生命生理活动所必需的基本组成. 此外, 只有20%的Sf301特异性ORFs同时存在于其他3个菌株中, 揭示了各菌株间基因组的异质性和菌属内的遗传多样性.

关键词：志贺氏菌属、大肠杆菌K-12、全基因组微阵列、骨架序列

所属期刊栏目：48

分类号：R37(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划G1999054105;国家高技术研究发展计划863计划2001AA223116;北京市科研项目H0102- 10360119

在线出版日期：2004-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2451-2546