基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析

摘要：

SARS(severe acute respiratory syndrome)冠状病毒已被世界卫生组织确认为SARS传染病的病原体, 它的全基因组测序工作分别由中国、加拿大、美国等国的研究小组完成.然而它的起源仍是一个谜.为了探寻SARS冠状病毒的来源, 基于FDOD(function of degree of disagreement)方法, 对12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒进行了全基因组比较, 构造出种系进化无根树.结果表明, 这两类病毒(分别由12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒构成)虽然都来自冠状病毒属, 但它们位于两个不同的进化分支上.冠状病毒属中的3个组被准确地重构.根据得到的结果, 推测SARS冠状病毒更类似于第一组中的冠状病毒.根据种系进化树的拓扑结构和各SARS冠状病毒分离株与造成香港Metropole饭店疫情的SARS冠状病毒株之间的联系, 推测各SARS冠状病毒分离株分别位于进化树上两个大的分支, 这为SARS的流行病学研究提供了辅助信息.

关键词：SARS SARS冠状病毒、冠状病毒、种系进化、传染途径、FDOD

所属期刊栏目：48

分类号：R37(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2002AA231031;中国科学院知识创新工程项目KSCX2-2-07和KJCX1-08

在线出版日期：2004-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1242-1245