降解多环芳烃的鞘氨醇单胞菌ahdA1c基因的生物信息学分析

摘要：

ahdA1c基因是鞘氨醇单胞菌降解多环芳烃中的关键基因.为了解鞘氨醇单胞菌ahdA1c基因基本特性,运用生物信息学方法预测分析其氨基酸理化性质、同源性、蛋白二三级结构、KEGG通路等.结果表明,ahdA1c基因编码区全长1 263 bp,编码420个氨基酸,与xylk基因、bphA1c基因的同源性均在90％以上;同源性较高;ahdA1c蛋白具有亲水性和稳定性,有31个磷酸化位点,2个保守区域,有跨膜区,无规则卷曲是二三级结构中最主要结构元件;KEGG分析表明ahdA1c蛋白编码水杨酸羟化酶.为进一步研究多环芳烃的降解机理奠定了基础.

关键词：生物信息学、基因芯片、鞘氨醇单胞菌、ahdA1c基因

所属期刊栏目：17

分类号：X172(环境生物学)

资助基金：国家自然科学基金青年基金41401355;山西省青年科技研究基金2014021034-2,2015021053

在线出版日期：2018-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：163-169