基于互信息和距离相关性算法的乳腺癌信号转导通路串扰

摘要：

乳腺癌(breast cancer,BC)作为女性最常见的恶性肿瘤迄今为止起因尚不明确.近年来针对单个基因或单条信号通路(pathway)的研究难以分析疾病的复杂发病机理.考虑到信号传导通路之间普遍存在相互关联和相互串扰的分子生物学特性,从基因之间的关联性出发,首先基于互信息(mutual information,MI)算法提取出了BC患病和健康对照样本中关联度具有明显变化的基因作为特征基因,在此基础上,基于KEGG通路分析获取特征基因所涉及的信号传导通路,并利用距离相关性(distance correlation,DC)算法度量它们之间的串扰关系,最终探寻到26条BC患病前后串扰关系变化较大的通路,通过生物学分析得到:胰岛素信号通路(insulin signaling pathway)、Ⅰ型糖尿病信号通路(type Ⅰ diabetes mellitus pathway)、核糖体(ribo-some pathway)信号通路等通路间的串扰及特征基因的显著变化对BC的发生和发展具有重要的推动作用.研究结果为探寻BC的致病机理提供了新的思路和有益的支撑.

关键词：乳腺癌(BC)、互信息(MI)、距离相关性(DC)、通路串扰

所属期刊栏目：17

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金61271466;上海市教委科研创新项目15ZZ079

在线出版日期：2017-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：205-211