桃钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶基因家族鉴定与分析

摘要：

钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶(CIPKs)在植物生长发育和抗逆过程中发挥着重要作用.为了对桃中CIPK家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CIPK家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析.结果表明,桃基因组中含有18个CIPK基因,分布于桃的6条染色体上.MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CIPK蛋白均含有2个保守的PKinase和NAF结构域.进化树分析表明CIPKs可分为2个亚家族.NetPhos 2.0 Server结果显示PpCIPKs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点.以上结果将为今后揭示桃CIPK蛋白的功能提供重要的理论基础.

关键词：钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶、桃、基因家族、进化分析

所属期刊栏目：16

分类号：Q516(蛋白质)

资助基金：北京市农林科学院青年科研基金项目QNJJ201416;北京市科技计划Z151100001015005;北京市农林科学院科技创新能力建设专项KJCX20140202

在线出版日期：2016-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：127-131