肾综合征出血热患者血浆cf-DNA特征及其深度测序分析

摘要：

探讨肾综合征出血热(HFRS)患者血浆cf-DNA含量与不同病情、病期等指标的相关性,定性分析游离DNA (cf-DNA)的来源与特征.收集了47例HFRS不同病情患者不同病程的128份血浆标本,以及20例健康志愿者的20份血浆标本.定量分析血浆总cf-DNA水平,提取纯化cf-DNA后进行定性分析,对其中9份HFRS患者血浆标本进行DNA高通量测序和生物信息学分析.统计学分析各参数指标间相关性.健康人血浆cf-DNA水平中位数为919.0 ng/mL,HFRS患者血浆cf-DNA含量明显增高,随着病程进展呈现动态变化的规律.轻型/中型患者与重型/危重型患者有着明显不同的分布格局:发热期cf-DNA水平即明显高于健康对照,在低血压休克期达到峰值,然后逐步下降,至多尿期与健康对照无显著性差异;急性期重型/危重型患者cf-DNA平均水平显著高于同期轻型/中型患者水平(p ＜0.001).健康人cf-DNA多为高分子量大片段DNA,而患者血浆cf-DNA高度富集于150 ～ 200 bp区域,显示为凋亡片段;血浆cf-DNA片段读长(reads)均匀分布于人类基因组的各条染色体,分布频度与染色体长度高度正相关(p＜0.001),且与HTNV病毒基因组无同源性.HFRS患者,急性期血浆cf-DNA即明显升高,并且随病程进展的不同分期与病情分型,呈现出动态变化的规律.HFRS患者血浆cf-DNA主要来源于疾病状态下,机体细胞发生凋亡后产生的基因组和线粒体DNA断裂片段,不包含HTNV病毒基因组成分.

关键词：游离脱氧核糖核酸、肾综合征出血热、汉滩病毒、胱氧核糖核酸测序

所属期刊栏目：16

分类号：R373.3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：陕西省自然科学基础研究计划项目2014JM2-3021;国家自然科学基金81301417

在线出版日期：2016-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：151-155,161