基于宏基因组数据的微生物群落比较方法

摘要：

宏基因组学是一门研究直接来自环境的基因材料的新兴学科.传统的微生物学研究,依赖于实验室培养,而宏基因组学,使得对这些未被培养或不可培养的微生物的研究成为可能,也为同一环境中微生物之间相互作用的研究,以及微生物群落的整体研究,指明了新的方向.随着测序技术的迅速发展,大量宏基因组测序数据不断产生,对新的统计分析方法提出了更高的要求.简要介绍了宏基因组学以及其中的几个重要问题,主要针对其中基于测序数据的群落比较问题进行论述,介绍了多种现今常用的统计计算方法,并分析了它们的适用情况.

关键词：宏基因组、16S rRNA、全基因组测序、群落比较、系统发生树

所属期刊栏目：13

分类号：Q93-31(微生物学)

在线出版日期：2013-05-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2457-2464