基于混合核和加权SVM的microRNA前体识别算法

摘要：

MicroRNA是一种单链RNA小分子,是由具有发夹结构的、更长的单链RNA前体经加工后生成.相比microRNA序列本身而言,其前体序列和二级结构隐含了更多的可识别特征与信息.因此可利用加权Levenshtein距离,结合其前体序列和二级结构构造一个指数核函数.结合SVM构造识别模型,鉴别真假前体.在用5折叠法得到最佳识别模型后,对人类数据进行测试.实验结果显示,新方法表现出了较好的识别精度,和较高的敏感性与特异性.

关键词：混合核、支持向量机、microRNA前体

所属期刊栏目：13

分类号：Q522.2(核酸)

资助基金：江苏省自然科学基金BK2004142;国家自然科学基金60405001

在线出版日期：2013-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：126-129,135