10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响
目的 探索HPRT1 基因在肺腺癌中的表达特征、总生存率、功能激活以及免疫浸润中的影响.方法 通过对TCGA肺腺癌数据以及多个GEO数据库中的肺腺癌数据进行挖掘分析,对比并验证HPRT1 表达量与预后总生存(overall surival,OS)的关系,通过clusterProfiler分析HPRT1 基因高表达组中上调基因的功能富集情况.且通过TIMER以及CIBERSORT算法计算肺腺癌中不同免疫细胞的浸润水平并对比在HPRT1 高低表达组间的浸润程度差异.结果 HPRT1 在肺腺癌组织中表达量显著上调,且在TCGA中证明HPRT1 基因高表达的患者预后OS更差(P<0.01).经过 2 个GEO数据集的验证同样发现HPRT1 基因高表达表现为预后OS更差(GSE13213,P<0.01;GSE67639,P<0.001).差异分析显示高表达的患者中有 683 个基因的表达量显著上调且这些上调基因的功能主要富集与p53 以及细胞周期等癌症相关的信号通路.TIMER以及CIBERSORT算法进行的免疫细胞浸润程度分析发现在高表达差预后人群中B细胞以及CD4T细胞含量均更低(P<0.05).结论 HPRT1 基因表达量越高肺腺癌患者的总生存越差,且高表达患者的p53 信号通路上调,B细胞以及CD4T细胞浸润程度显著下降.
肺腺癌、HPRT1基因、总生存、数据挖掘
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R734.2(肿瘤学)
湖南省自然科学基金科卫联合基金资助项目2020JJ8080
2024-09-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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