基于生物信息学方法识别肺腺癌预后相关基因

摘要：

目的 利用生物信息学方法筛查肺腺癌的差异基因,分析其在肺腺癌的发生发展过程中可能参与的信号传导通路,寻找肺腺癌的关键基因并评估其对肺腺癌预后的意义.方法 从GEO数据库中获取肺腺癌基因表达芯片数据集GSE10072、GSE32863、GSE43458和GSE116959,将四组数据集整合后获得肺腺癌的差异表达基因,采用STRING数据库对差异表达基因构建肺腺癌蛋白-蛋白互相作用网络,通过在线网站DAVID对差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,用Cytohubba筛选关键基因,并利用GEPIA分析关键基因与预后的相关性.结果 初步筛查得到214个差异基因,包括42个上调基因和172个下调基因,最后筛选得到6个关键基因.生存分析显示PECAM1、SPP1和KIAA0101的表达对肺腺癌的预后有显著影响(P<0.05),Diseasemeth分析显示SPP1、KIAA0101、COL3A1、GNG11和FOS基因在肺腺癌组织中的甲基化水平异常(P<0.05).结论 这6个基因可能参与了肺腺癌的发生发展,对肺腺癌的诊断、靶点治疗和预后提供一定参考.

关键词：生物信息学、肺腺癌、基因、生存分析、预后

所属期刊栏目：41

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：昆明医科大学科技创新团队基金资助项目CXTD201706

在线出版日期：2020-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：30-37