N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺侧链构象的理论分析

摘要：

目的 分析N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺的非键和静电相互作用、拓朴能、键角的弯曲和氢键,研究它们的空间结构.方法 当主链的最大构象可能性确定时,侧链的键角和两面角(ψ),ψ在每一点变化的情况下,用能量低化的方法得到了构象图,并评价了主链和侧链的空间的相互制约性.当主链为低能式而侧链具有最大拓朴势时,(ψ),ψ,x1-x5角的所有组合作为初始近似的情况下,计算了分子的优势构象.结果 N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺的稳定构象与赖氨酸残基在蛋白质中的已知结构的几何构型相符合.结论 赖氨酸残基在蛋白质中构象即为赖氨酸孤立单肽的优势构象.

关键词：N-乙酰基-L-赖氨酸-甲酰胺、构象分析、空间结构

所属期刊栏目：28

分类号：Q641.6(生物电磁学)

资助基金：云南省教育厅资助项目5Y501C

在线出版日期：2008-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：17-21,25