Illumina MiSeq高通量测序分析花生仁内生细菌多样性

摘要：

为了调查花生仁内生细菌种类多样性,应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定花生仁内生细菌的16S rDNA-V4变异区序列,并采用Mothur软件整理及统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和 α多样性.研究获得用于分析的有效序列和OTU数分别为69284和25;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和.花生仁内生细菌主要分布于食酸菌属(Acidovorax)和希瓦氏菌属(Shewanella),丰度分别为83.33％和16.67％.且内生细菌的Chao1指数为25.00,Shannon指数为1.29.

关键词：高通量测序、花生仁、内生细菌、多样性

所属期刊栏目：40

分类号：S565.2(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31460491;昆明学院人才引进项目YJL14005;云南省高校优势特色重点学科生态学建设资助项目05000511311;云南省特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金资助项目GXKJ201621

在线出版日期：2018-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：86-89