R语言编程对SNP的分析

摘要：

单核苷酸多态性(SNP)是生物遗传多态性的一种类型,在各种生物中普遍存在.由于单核苷酸变异可以发生在基因组几乎任何位点上,SNP位点数量巨大且分布极为广泛,成为SNP研究的一大难点.然而,随着生物信息学的蓬勃发展,对于SNP研究已不再像当初一样困难,这样的突破使SNP越来越受到科学家的重视.由于SNP数据量大,分析繁杂,使用统计分析软件R语言分析SNP无疑是一种极为高效的方法.本文介绍了如何利用R语言分析SNP数据,以及如何利用曼哈顿图、连锁不平衡热图和火山图来实现SNPs的可视化,并给出了编程代码.

关键词：SNP、生物信息学、R语言、qqman、连锁不平衡热图、火山图

所属期刊栏目：15

分类号：TP313(计算技术、计算机技术)

在线出版日期：2019-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：146-149