10.16259/j.cnki.36-1342/s.2021.02.003
油茶CYP78A10同源基因及其SSR位点
拟南芥(Arabidopsis thaliana)CYP78A亚基因家族基因参与种子大小的遗传控制.对普通油茶(Camellia oleifera)转录组数据进行挖掘,从花蕾和根转录组数据中分别得到1条CYP78A10的同源基因,再从油茶基因组三代测序数据中鉴别出其基因组DNA序列,最后,得到2条油茶CYP78A10同源基因全长CDS序列,分别命名为CoCYP78A10a、CoCYP78A10b.用植物CYP78A亚基因家族基因的蛋白质序列构建进化树,结果表明,CoCYP78A10a、CoCYP78A10b与CYP78A10、GmCYP78A10在一个分支,可能参与油茶种子大小的调控.通过SSR位点信息分析,在CoCYP78A10a第1外显子5'端非翻译区、CoCYP78A10b的启动子区分别发现1个适宜进行SSR分子标记开发的多态性位点.
普通油茶、CYP78A10、SSR、种子大小、同源基因
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S794.4;Q75(森林树种)
江西省科技厅科技项目20143ACF60013
2021-06-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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