金针菇成熟期和伸长期菌盖的转录组与蛋白组比较分析

摘要：

菌盖是大型真菌的重要组成部分,也是其产生有性孢子的部位,但是其发育机制仍不明确.本研究以金针菇Flammulina filiformis为材料,采用转录组和蛋白组联合分析的方法,比较分析了金针菇成熟期和伸长期菌盖的差异基因与蛋白,并对其进行GO(gene ontology)功能聚类分析、KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析和蛋白互作网络分析.本研究筛选到差异表达基因有1391个,差异表达蛋白147个,均以上调表达为主.GO功能聚类分析结果表明,催化活性(catalytic activity)条目富集基因最多,其次是细胞组分(cell part)、细胞过程(cellular process)和细胞器(organelle).KEGG富集分析结果表明,差异表达基因和蛋白主要富集在碳水化合物代谢通路(carbohydrate metabolism)和氨基酸代谢通路(amino acid metabolism)等.本研究选取了9个关键的差异表达基因,使用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)对其表达量进行了验证.RT-qPCR验证结果与转录组测序结果相一致.蛋白互作网络分析表明,水解酶类、结构域类和转录调节类蛋白为互作网络的主要结点.本研究联合转录组、蛋白组测序数据,通过分析差异基因与蛋白,为深入了解金针菇菌盖发育机制提供数据参考.

关键词：金针菇、菌盖发育、转录组、蛋白组

所属期刊栏目：42

分类号：R714.5;S852.65;S

资助基金：国家自然科学基金;山东省现代农业产业技术体系食用菌产业体系

在线出版日期：2023-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共18页

页码：312-329