hsa-miR-197靶基因预测及生物信息学特征分析

摘要：

目的 通过对hsa-miR-197进行系统的生物信息学分析,预测其靶基因、相关功能及其可能参与的生物学过程.方法 通过PubMed检索hsa-miR-197相关文献；通过miRBase、NCBI等在线数据库获取并分析hsa-miR-197序列保守性及其基因组特征.通过GO功能注释、GO富集分析和信号转导通路富集分析,选择miRanda、TargetScan及PicTar预测hsa-miR-197的靶基因的交集作为分析的基因集合.结果 (1) hsa-miR-197在人类同源的物种间具有高度保守性.(2)三种方法预测结果取交集获得hsa-miR-197可能的靶基因共有32个.(3) hsa-miR-197靶基因主要参与DNA修复、蛋白磷酸化、离子转运、蛋白修饰、DNA依赖的转录调控等生物学过程,涉及Wnt、氨基糖类代谢等信号转导通路.结论 hsa-miR-197的功能较广泛,与发育、代谢等密切相关.

关键词：hsa-miR-197、靶基因、生物信息学

所属期刊栏目：40

分类号：R346(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：国家自然科学基金青年科学基金81202042

在线出版日期：2014-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：398-401