2022年盐城市新型冠状病毒全基因组分子特征分析

摘要：

目的 分析2022年盐城市部分新型冠状病毒的分子进化特征.方法 通过高通量测序技术,对2022年5月以来盐城市新冠病毒代表样本进行全基因组测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸和分子进化3个层面进行分子特征分析.结果 盐城市代表毒株主要位于3个进化谱系,5-7月的毒株位于BA.2.2进化谱系,9月以后的毒株主要位于BF.7和BA.5.2进化谱系,在各自进化谱系中形成众多进化分支.代表毒株S蛋白在一些关键位点上均发生了 D614G、N501Y、E484A和L452R位点的变异,其他氨基酸位点变异呈散在性分布.结论 2022年盐城市新冠病毒的流行主要由输入病例造成散发或局部暴发,以BA.2.2、BA.5.2和BF.7为主,随着在人群中流行、时间推移可能会持续发生核苷酸位点的漂移;应加强新冠病毒株变异监测力度,及时发现能引起重症及流行的变异株.

关键词：新型冠状病毒、全基因组、高通量测序、序列分析、基因特征

所属期刊栏目：34

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2023-07-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：145-147,191