基于RNA-Seq鉴定黑羽番鸭肉质风味差异的候选基因

摘要：

为挖掘黑羽番鸭肉质风味相关候选基因,通过对黑羽番鸭胸肌、腿肌中挥发性风味物质进行测定,并通过Illumina HiSeq2500高通量测序进行转录组对比分析,结合参考基因组对所获得的序列进行序列比对、基因注释和差异表达等分析,筛选出差异表达基因并进行GO富集分析.通过荧光定量PCR(Real-time PCR,qRT-PCR)方法检测4个差异候选基因表达水平,验证测序结果的可靠性.结果表明,黑羽番鸭胸肌中挥发性风味物质辛醛、2,3-辛二酮含量显著高于腿肌,3-羟基-2-丁酮含量显著低于腿肌(P<0.05).通过参考基因组比对和差异表达分析,初步获得614个差异表达基因,171个差异基因在黑羽番鸭腿肌组织上调表达,443个差异基因在黑羽番鸭腿肌组织下调表达.结合GO分析和KEGG富集分析,最终获得了20个候选功能基因,它们分别参与机体氨基酸形成、糖代谢以及脂肪代谢等生物过程,其中10个差异候选基因在黑羽番鸭胸肌中参与肌内脂肪代谢过程,这些基因可能通过形成肌内挥发性风味物质进而影响肌肉风味.qRT-PCR验证结果表明,筛选出的差异候选基因表达趋势与转录组测序中表达的趋势相似,说明测序结果可靠.在黑羽番鸭胸肌、腿肌中挥发性风味物质对比基础上,结合RNA-Seq技术对黑羽番鸭肉质风味前体物质特异性形成机制进行综合分析,筛选出ACOT11、APOA1、FABP3等脂肪代谢相关的差异基因可能与黑羽番鸭胸、腿肌肉质风味形成相关.

关键词：黑羽番鸭、挥发性风味物质、脂肪代谢、转录组测序

所属期刊栏目：38

分类号：S834+.89(家禽)

资助基金：泰州市科技支撑项目;江苏省农业重大新品种创制项目

在线出版日期：2022-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：739-747