不同鸡种BF1基因SNP和Indel比对分析

摘要：

鸡BF1基因多态性与传染性疾病的抗性有很大关系.鸡BF1基因多态性及功能尚不清楚.本研究直接测定了25个鸡种BF1基因序列,并与从NCBI下载的红色原鸡BF1基因进行了比较,构建系统进化树进行分析.结果显示,在这25个鸡种中共检测到了171个单核苷酸多态性(SNP),其中外显子上发现了108个SNP.这些外显子中SNP位点编码氨基酸166个,其中有58个氨基酸发生变异,氨基酸序列同源性高于核苷酸.外显子4和外显子1的SNP数量最多,占46％以上,第5、第6、第7、第8外显子属于保守区域.核苷酸序列缺失主要发生在外显子1和内含子5上.25个鸡种根据地理位置和气候环境大致可被分为3大类.说明,BF1基因在核苷酸多态性水平上存在较高的变异性,为鸡抗病育种提供了基础.

关键词：鸡MHC、BF1基因、SNP、INDEL

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分类号：S858.31(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家科技支撑计划项目2015BAD03B03;江苏省六大人才高峰项目2015-NY-019

在线出版日期：2018-12-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1087-1094