中国甘薯双生病毒C4基因分子变异及遗传多态性分析

摘要：

甘薯双生病毒是中国甘薯上一种重要的病毒,其C4基因编码的蛋白是一个多功能蛋白,参与了寄主症状的形成及病毒在植物体内移动等.本研究利用PCR方法扩增了24个分离物的C4基因,通过SDT、DnaSP等软件分析,结果表明,24个分离物核苷酸序列均为258个碱基,一致率为73.3%~100.0%,编码85个氨基酸,一致率为47.1%~100.0%.中国甘薯双生病毒分离物C4基因构建系统进化树分为2个组,组Ⅰ包括本研究的15个双生病毒分离物及中国大部分双生病毒分离物,又分为2个亚组,亚组2仅有15个双生病毒分离物,其中本研究的6个分离物位于此亚组;组Ⅱ含有30个双生病毒分离物,包括本研究的9个分离物.非同义突变与同义突变比值大于1,说明C4基因处于正向选择.亚组1错配分布图为单峰,说明该组种群呈突然暴发的状态,其余组或亚组为多峰锯齿状,表明种群或者亚种群已经存在很长时间,长期处于动态平衡.

关键词：甘薯双生病毒、C4基因、分子变异、遗传多态性

所属期刊栏目：33

分类号：S435.311(病虫害及其防治)

资助基金：江苏省自然科学基金项目BK20140230;国家甘薯产业技术体系项目CARS-11-B-09;江苏省农业科技自主创新基金项目CX135080

在线出版日期：2017-07-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：487-492