单核苷酸多态性在疾病相关性分析中的编码问题研究

摘要：

作为第三代遗传标记的单核苷酸多态性(SNP)具有数量众多、分布广泛且遗传稳定性等特点,其是疾病-基因相关性以及药物设计等研究的基础所在.这类研究多采用基于计算的方法,因此如何对SNP进行适当的编码进而提升算法的性能是其中十分关键的一个环节,然而目前专门针对SNP编码问题的研究还相对较少.在常用SNP表示方式的基础上,根据疾病易感性研究的特点,并结合SNP之间的关联性,提出了几种新的编码方法.大量实验表明,编码方式对疾病易感性分析算法的性能有着较大的影响,基于分布信息的编码方法能获得更好的结果,即其能更好地对SNP序列进行描述,在最大程度上保留原有生物序列所携带的丰富信息,更适合于疾病易感性研究.

关键词：单核苷酸多态性、编码、疾病易感性

所属期刊栏目：43

分类号：TP183(自动化基础理论)

资助基金：陕西省教育厅科研计划项目15JK2187;西京学院科研基金项目XJ140115;武警工程大学基础研究基金项目WJY201518

在线出版日期：2016-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：219-221,235