基于序列的G蛋白偶联受体-药物相互作用预测研究

摘要：

准确预测G蛋白质偶联受体(GPCR)是否与药物(Drug)相互作用是新药开发的关键步骤之一.从时间和费用方面来说,通过生物实验的方法来确定GPCR-Drug是否相互作用的代价是昂贵的.因此,直接从蛋白质序列出发预测GPCR-Drug的相互作用具有重要的意义.提出了一种基于序列的GPCR-Drug相互作用预测方法:从蛋白质序列抽取进化信息特征;对药物抽取指纹特征;基于上述两种特征,使用基于证据理论的K近邻算法进行分类预测.在标准数据集上的实验结果表明了所述方法的有效性.

关键词：G蛋白质偶联受体、药物、特征抽取、预测

所属期刊栏目：42

分类号：TP18(自动化基础理论)

资助基金：国家自然科学基金61373062;江苏省自然科学基金BK20141403

在线出版日期：2015-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：75-77,111