PPI网络聚类的评价方法的研究与应用

摘要：

蛋白质相互作用网络(Protein-Protein Interaction,PPI)聚类结果的评价方法的研究是检测PPI网络功能模块聚类结果正确与否的关键.介绍并分析了4种有代表性的PPI网络聚类的评价方法,即p-value、匹配统计量、基于准确率和查全率的综合评价以及基于层结构的hF-measure,在此基础上考虑了主错误划分类与该预测类的相似性,提出了新的罚分函数和新的Sf-measure评价方法.仿真结果表明了各评价方法的特点及Sf-measure评价方法的有效性及合理性.

关键词：蛋白质相互作用网络、评价方法、调和平均值、主错误划分类、Sf-measure

所属期刊栏目：40

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金青年基金61100164,61173190;教育部留学回国人员科研启动基金教外司留[2012]1707号;陕西省2010年自然科学基础研究计划青年基金2010JQ8034

在线出版日期：2014-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：254-258