一种序列相关支持向量机的β桶状跨膜蛋白预测方法

摘要：

膜蛋白是一种具有重要生物功能的蛋白质,根据蛋白质的序列信息预测其是否属于β桶状跨膜蛋白是结构预测与功能分析的重要先导步骤,也是蛋白质预测领域中的一个挑战性问题.针对这两类问题,提取了208条β桶状跨膜蛋白序列的氨基酸位置与理化特征.利用支持向量机(SVM)进行了预测,结果表明二分类精度与相关系数分别达到了88.36％与0.7723.

关键词：跨膜蛋白、支持向量机、β桶状

所属期刊栏目：39

分类号：TP305(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金项目60970055,61170125

在线出版日期：2012-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：252-255